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Arrêt maladie en micro-entrepreneur : indemnités et démarches

Arrêt maladie en micro-entreprise : conditions, 3 jours de carence, calcul des indemnités journalières avec exemples en € et démarches auprès de la CPAM.

IK
Ibrahim Kamara

Entrepreneur & Créateur de contenu

Publié le 2026-11-12

Illustration d'un micro-entrepreneur en arrêt maladie devant son ordinateur

La réponse en bref

Un micro-entrepreneur peut toucher des indemnités journalières (IJ) de la CPAM s'il est affilié depuis au moins un an et si ses revenus passent un seuil minimal. Elles démarrent après 3 jours de carence (donc dès le 4ᵉ jour) et se calculent sur la moyenne de tes revenus cotisés des 3 dernières années, soit environ 1/730ᵉ de ce revenu par jour.

✅ À retenir

  • Ce sont la CPAM qui paie et l'Urssaf qui encaisse tes cotisations : ton arrêt va à la CPAM.
  • Conditions : 1 an d'affiliation et un revenu moyen suffisant (environ 4 582 € par an pour un arrêt débuté en 2026).
  • 3 jours de carence : rien n'est versé les 3 premiers jours.
  • Ton revenu pris en compte, c'est ton chiffre d'affaires après abattement forfaitaire, pas ton chiffre d'affaires brut.

Voici les conditions, un calcul chiffré en € selon ton activité, et les démarches à faire dès que ton médecin t'arrête.

Les conditions pour toucher des indemnités

Selon l'Urssaf, un indépendant peut bénéficier d'indemnités journalières en cas d'arrêt de travail « selon ses revenus » et à condition d'être affilié à la CPAM depuis au moins un an. Un délai de carence s'applique : les IJ sont versées à partir du 4ᵉ jour, en cas d'hospitalisation, de maladie ou d'accident.

ConditionCe que ça veut dire
AffiliationAu moins 12 mois d'affiliation au moment de l'arrêt
RevenuRevenu annuel moyen des 3 dernières années au-dessus d'un minimum (10 % du plafond de la Sécurité sociale moyen, soit environ 4 582 € en 2026)
Carence3 jours non indemnisés
OrganismeCPAM de ton lieu de résidence (CGSS dans les Drom)

Si tu démarres ton activité, tu ne seras donc pas couvert tout de suite. Si tu étais salarié ou au chômage juste avant, l'Assurance maladie peut examiner tes droits au titre de ton ancienne activité : demande-le à ta CPAM.

Comment sont calculées les indemnités

L'Urssaf précise que le montant des prestations d'un auto-entrepreneur est calculé « sur la base du chiffre d'affaires annuel, diminué de l'abattement forfaitaire » (71 % pour la vente, 50 % pour les services BIC, 34 % pour les activités libérales). Selon l'Assurance maladie, l'IJ vaut environ 1/730ᵉ du revenu annuel moyen des 3 années précédentes, plafonné : avec un plafond de la Sécurité sociale 2026 de 48 060 €, cela donne 65,84 € par jour au maximum.

Exemples en € (illustratifs)

ActivitéCA annuel moyenRevenu retenuIJ par jour
Vente de marchandises (abattement 71 %)40 000 €11 600 €≈ 15,89 €
Services BIC (abattement 50 %)30 000 €15 000 €≈ 20,55 €
Libérale (abattement 34 %)20 000 €13 200 €≈ 18,08 €
Indemnité journalière estimée selon l'activité
Vente (CA 40 000 €)15,89 €/jour

11 600 € / 730

Services BIC (CA 30 000 €)20,55 €/jour

15 000 € / 730

Libérale (CA 20 000 €)18,08 €/jour

13 200 € / 730

Source : calcul de l'article d'après la méthode décrite par l'Urssaf et l'Assurance maladie ; exemple illustratif

Pour 30 jours d'arrêt en services BIC (exemple ci-dessus), il y a 27 jours indemnisés : 27 × 20,55 ≈ 555 €, contre 2 500 € de chiffre d'affaires mensuel moyen (30 000 ÷ 12). Prévois donc une réserve.

À partir de quel chiffre d'affaires le seuil est-il atteint ?

Le seuil d'environ 4 582 € s'applique au revenu après abattement. En retournant le calcul :

ActivitéCA annuel moyen minimumCalcul
Vente≈ 15 800 €4 582 ÷ 0,29
Services BIC≈ 9 164 €4 582 ÷ 0,50
Libérale≈ 6 942 €4 582 ÷ 0,66

C'est un repère issu de notre calcul : ta CPAM reste seule juge de ton droit, sur ton revenu cotisé réel.

Les démarches quand tu es arrêté

  1. Fais-toi prescrire l'arrêt

    Ton médecin établit l'arrêt de travail (maladie, accident ou hospitalisation).
  2. Envoie-le vite à la CPAM

    Transmets les volets à ta CPAM, en pratique sous 48 heures : au-delà, tu risques une réduction ou un refus. Vérifie le délai exact auprès de ta caisse.
  3. Continue de déclarer ton chiffre d'affaires

    Déclare à l'Urssaf, même à 0 €, aux dates habituelles : voir la déclaration Urssaf pas à pas.
  4. Suis ton dossier

    La CPAM calcule tes IJ d'après tes revenus cotisés. Garde tes arrêts et tes relevés.

☑️ Avant et pendant l'arrêt

0/5

Ce qui ne marche pas

SituationPourquoiQue faire
Moins d'un an d'activitéCondition d'affiliation non remplieDemande à la CPAM l'examen de tes droits antérieurs
CA très faibleRevenu moyen sous le seuilUne assurance prévoyance privée peut compléter
Profession libérale réglementéeAu-delà du 90ᵉ jour, c'est ta caisse de retraite qui est l'interlocutrice (Urssaf)Renseigne-toi auprès de ta caisse
Arrêt envoyé trop tardRisque de réductionEnvoie les volets tout de suite

Les IJ ne remplacent pas un salaire : pour te protéger, pense à te constituer une réserve de trésorerie et à connaître les charges de l'auto-entrepreneur. Si ton activité s'arrête, vois aussi le chômage pour un auto-entrepreneur.

Questions fréquentes

Un micro-entrepreneur a-t-il droit à un arrêt maladie ?

Oui, mais il touche des indemnités journalières de la CPAM seulement s'il est affilié depuis au moins un an et si ses revenus sont suffisants.

Quel est le délai de carence d'un auto-entrepreneur ?

3 jours : les indemnités journalières sont versées à partir du 4ᵉ jour d'arrêt, selon l'Urssaf.

Qui verse les indemnités, l'Urssaf ou la CPAM ?

La CPAM (CGSS dans les Drom). L'Urssaf encaisse les cotisations.

Comment est calculée l'indemnité journalière ?

Sur la moyenne des revenus cotisés des 3 dernières années, après abattement forfaitaire, soit environ 1/730ᵉ du revenu annuel moyen.

Combien de temps pour envoyer l'arrêt à la CPAM ?

En pratique 48 heures. Confirme le délai exact avec ta CPAM.

Pour aller plus loin

Comment cet article est fait : rédigé avec l'aide de l'IA à partir de recherches et de captures d'écran réelles, puis relu et validé par Ibrahim Kamara avant publication.

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